С 15.07.1941 г. входил в состав 6-го иак ПВО Москвы. Оснащен самолетами И-16, базировался на аэродроме в Чертаново (Москва).
25-27.08.1941 г. переведен на Ленинградский фронт в состав 8-й сад. В этот период на вооружении полка были 17 самолетов Як-1.
15 февраля 1942 года выведен в резерв и передан в состав ВВС ВМФ СССР. Был вооружён самолётами Пе-3, направлен на Северный флот, где в июле 1942 года вошёл в состав Особой морской авиационной группы (ОМАГ). Приступил к боевым действиям 15 сентября 1942 года. Приказом НК ВМФ СССР от 23 октября 1942 года расформирован вместе с ОМАГ, но уже 6 ноября 1942 года вновь воссоздан. Главной задачей полка являлось прикрытие своих конвоев от авиации противника; также прикрывал торпедоносцы при налётах на конвои противника, производил налёты на аэродромы и морские базы. Базировался на маневренных аэродромах у реки Поной и на мысе Канин Нос.
Действовал в составе ВВС Северного флота(ВВС СФ). В середине 1943 года передал уцелевшие Пе-3 в 95-й иап ВВС СФ.