86-й пограничный отряд нес охрану участка государственной границы, окаймляющего с востока и юга так называемый Сувалковский выступ, протяженностью 139 километров, от стыка Белоруссии с Литвой и ниже до ближайших окрестностей города Граево. Линия государственной границы проходила по бывшей территории Августовского уезда через массив густых лесов и в 15 км от Августова и на северо-западе соединялась со старой границей Польши и Восточной Пруссии.
Пограничный отряд охранял границу на территории Сопоцкинского, Гродненского, Августовского и Граевского районов Белостокской области Белорусской ССР, ныне территории двух последних районов входят в состав Польской Республики.
Отряд сформирован в соответствие с приказом НКВД СССР № 001121 от 20 сентября 1939 года, на базе 14-го Плещеницкого погранотряда погранвойск НКВД Белорусской ССР. Штаб пограничного отряда с подразделения обеспечения располагался в г. Августов Белостокской обл. Приказом заместителя народного комиссара внутренних дел СССР по пограничным и внутренним войскам генерал-лейтенанта И. И. Масленникова от 26 июня 1941 года остатки уцелевших подразделений пограничных отрядов, были выведены в тылы Красной армии и переформированы в пограничные полки НКВД с сохранением порядкового номера. Им была поставлена задача по охране тыла действующей армии, которую они выполняли совместно с внутренними войсками НКВД.